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Su gestión al frente de la Universidad EAN, cargo que asumió el primero de septiembre de 2019, se destaca por líderar una línea de consultoría corporativa que vincula, a través de la investigación aplicada, a empresas y científicos en líneas como desarrollo de energías limpias y construcción sostenible. Además, porque bajo su administración se llevó a cabo la planeación y ejecución del Edificio Legacy, la apuesta de Ean por el desarrollo sostenible: el primer edificio del Colombia construido bajo principios de economía circular. Una edificación de 10 pisos. Baptiste también es recordada porque durante 10 años fue la directora general del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt.
